柱型苹果MADS-box家族的2个同源基因克隆与生物信息学分析
2012-04-28分类号:S661.1
【部门】青岛农业大学园林园艺学院
【摘要】基于笔者前期进行的柱型苹果转录组测序(RNA-seq)结果,采用RT-PCR方法,从柱型苹果花芽中克隆了MADS-box基因家族的2个同源基因,分别命名为MdSOCla和MdSOClb。分析结果表明,MdSOCla开放阅读框长度为708 bp,编码235个氨基酸,蛋白质分子量为26.95 kDa,等电点为9.13;MdSOClb开放阅读框长度为717 bp,编码238个氨基酸,蛋白质分子量为27.49 kDa,等电点为9.61。MdSOCla和MdSOClb的编码区碱基序列相似性为83.49%,氨基酸的相似性为73.72%。MdSOCla和MdSOClb的第1~75个氨基酸为高度保守的MADS...
【关键词】柱型苹果 MADS-box SOC1基因 基因克隆
【基金】国家现代苹果产业技术体系(CARS-28-01-07); 山东省优秀中青年科学家科研奖励基金(BS2009NY023); 山东省良种产业化工程(No.620902); 青岛市科技发展计划(11-2-4-5-6-jch); 青岛农业大学高层次人才启动基金(630732)
【所属期刊栏目】华北农学报
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