烟草叶片全长cDNA文库构建及EST序列分析
2012-05-01分类号:S572
【部门】中国农业科学院烟草研究所/中国农业科学院烟草遗传改良与生物技术重点开放实验室
【摘要】【目的】构建烟草叶片全长cDNA文库并测序,发掘与烟叶发育、代谢和抗逆相关的基因,为进一步研究功能基因奠定基础。【方法】以烟草苗期叶片为试验材料,利用改进的Cap-trapper法构建烟草叶片全长cDNA文库。利用测序技术获得大量的EST序列,采用生物信息分析手段,对所测EST进行拼接和功能注释。【结果】构建了烟草叶片的全长cDNA文库,该文库滴度为1.2×106pfu.mL-1,平均插入片段在1.4 kb左右。利用该文库测序了5 280个克隆,获得5 233条高质量表达序列标签(EST),序列拼接出3 922个单一基因;同源比对分析表明,89.7%的基因与已知功能基因具有较高的同源性,这些基...
【关键词】烟草 全长cDNA文库 表达序列标签 功能注释
【基金】国家烟草专卖局项目——烟草cDNA文库构建及重要基因表达谱研究(110200701021),国家烟草专卖局项目——烟草突变体库创建与功能基因组学研究(110200701022)
【所属期刊栏目】中国农业科学
文献传递