应用dsRNA测序技术检测草鱼呼肠孤病毒的混合感染
2012-09-15分类号：S943
【部门】上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室
【摘要】从草鱼(Ctenopharyngodon idellus)出血病疑似病料提取物感染的草鱼肾细胞(CIK)中提取病毒基因组dsRNA,电泳显示出水生呼肠孤病毒基因组的典型特征。应用简化的FLAC(full-length amplification of cDNA)技术扩增得到病毒的4个全长基因组片段进行测序分析。核酸序列BLAST分析表明:其中3个基因组片段与GCRV-873第5、9、10片段高度同源,另外1个基因组片段与GCRV-HZ08第11片段高度同源;因此推测病料中同时存在两种不同的病毒核酸,但也可能存在一种杂合病毒。根据已发表的GCRV-HZ08第5、9、10片段设计了3对引物对分离的...
【关键词】dsRNA测序 检测 草鱼呼肠孤病毒 混合感染
【基金】国家自然科学基金(31072244); 上海市浦江人才计划(10PJ1404800); 现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-46-12)
【所属期刊栏目】上海海洋大学学报
文献传递
