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齐口裂腹鱼同种移植炎症因子AIF-1的克隆及蛋白质结构预测

2012-04-28分类号:S917.4;Q51

【作者】王利  魏勇  龙钟明  刘港彪  苟小兰  
【部门】西南民族大学生命科学与技术学院动物遗传育种学国家民委-教育部重点实验室  四川省畜牧科学研究院  
【摘要】同种移植炎症因子AIF-1是一种细胞质的钙离子结合蛋白。本研究采用RT-PCR方法从齐口裂腹鱼脾脏中克隆到AIF-1,并运用生物信息学方法预测其蛋白质结构。结果表明:齐口裂腹鱼AIF-1基因包含一个444 bp的完整阅读框,编码一个由147个氨基酸组成的蛋白。AIF-1蛋白预测分子量为16.5 KDa,理论pI为4.43,无信号肽,有一个跨膜区,二级结构以α-螺旋为主,未见β-折叠区。同源建模显示齐口裂腹鱼AIF-1蛋白与已测定的小神经胶质细胞特定蛋白具有非常相似的三级结构。这为深入研究AIF-1分子结构和功能积累了参考资料。
【关键词】同种移植炎症因子AIF-1  克隆  蛋白质结构  齐口裂腹鱼
【基金】西南民族大学中央高校基本科研业务费专项资金项目(10NZYZJ02),西南民族大学研究生学位点建设项目(2011XWD-S071007)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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