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脊尾白虾3个野生群体ITS1序列分析及其亲缘关系分析

2012-08-15分类号:S917.4

【作者】马朋  刘萍  李健  
【部门】中国水产科学研究院黄海水产研究所  大连海洋大学水产与生命学院  
【摘要】对脊尾白虾的莱州湾、海洲湾、象山湾3个野生群体共计62个个体的核糖体RNA转录单元内间隔区ITS1基因片段进行克隆和测序,对序列特点进行分析,并结合GenBank数据库中已有的长臂虾亚科ITS1同源序列虾类进行系统分析。结果显示,脊尾白虾的ITS1序列具有长度多态性,其长度为345~384 bp,62条序列GC的平均含量显著高于AT含量;共检测到79个变异位点,39种单倍型,多态位点比例为21.7%;海洲湾群体遗传多样性指数最高,象山湾群体次之,莱州湾群体最低。在脊尾白虾ITS1序列中发现微卫星序列共有8处,重复序列类型为(GC)n、(AG)n、(GGC)n、(GGA)n、(AT)n、(GA)...
【关键词】脊尾白虾  ITS1  遗传多样性  系统进化
【基金】国家“八六三“高技术研究发展计划(2012AA10A409); 国家虾产业技术体系(CARS-47); 山东省科技发展计划项目(2011GHY11526)
【所属期刊栏目】水产学报
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