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鸡Lpin1基因3′-UTR遗传变异及其对miRNA结合位点的潜在效应

2012-04-16分类号:S831

【作者】李素雅  张建宏  陈文  黄艳群  孙桂荣  韩瑞丽  康相涛  
【部门】河南农业大学生命科学学院  河南农业大学牧医工程学院/家禽种质资源创新工程中心  
【摘要】【目的】研究鸡Lpin1基因3′-UTR遗传变异/单倍型及其在品种间的分布,并预测这些变异对miRNA结合位点的潜在效应。【方法】根据鸡Lpin1基因组序列(GenBank登录号:NC_006090)设计一对特异性引物,采用PCR直接测序结合克隆测序的方法,进行鸡Lpin1基因3′-UTR及其邻近外显子在品种间的遗传变异/单倍型分析【。结果】①从6个品种中发现了8个变异位点,包含两个插入/缺失变异。这些变异均位于鸡Lpin1基因的3′-UTR,3′-UTR的变异频率为17SNPs/kb;②在鸡Lpin1基因3′-UTR区域,从固始鸡、卢氏绿壳蛋鸡中分别检测到7个变异位点,未检测到河南斗鸡品种内...
【关键词】鸡  Lpin1基因  3′-UTR  遗传变异  miRNA靶位点
【基金】国家自然科学基金(30771533); 郑州市创新型科技人才队伍建设工程科技创新(096SYJH16092); 家养动物种质资源平台
【所属期刊栏目】中国农业科学
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