日本落叶松小RNA文库构建及其microRNA鉴定
2012-12-15分类号：S791.223
【部门】中国林业科学研究院林业研究所细胞生物学实验室 云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所
【摘要】以2年生日本落叶松实生苗为材料构建其小RNA文库,对283个克隆进行PCR验证后测序,通过生物信息学分析鉴定文库中的microRNA并进行qRT-PCR验证。结果表明:(1)小RNA文库的体积为50 mL,总库容量为5.25×106cfu,重组率为92.6%,插入片段长度约65 bp,与小RNA连接片段长度吻合。(2)去除rRNA(86个)、tRNA(14个)等非目的序列后,获得日本落叶松28个保守miRNAs,属于17个miRNA家族;其中,15个miRNAs(miR159c、miR160a、miR162a、miR164b、miR165a、miR166a、miR166a*、miR166b*、...
【关键词】日本落叶松 小RNA 文库 miRNA 转录组
【基金】国家自然科学基金重点项目(30830086); 国家“973”项目(2009CB119106)资助; 国家“863”计划重点项目(2011AA100203)
【所属期刊栏目】林业科学研究
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