基于芭蕉属EST序列的地涌金莲SSR引物开发
2012-04-15分类号：S682.19;Q943
【部门】中国林业科学研究院资源昆虫研究所
【摘要】对31 308条来自NCBI的芭蕉属(Musa)EST序列进行拼接得到全长为13.51 Mb的21 129条无冗余EST序列(含3 818条contigs及17 311条singletons),其中,4 944条(23.40%)EST序列含有5 416条SSRs,SSR的出现频率为25.63%,平均分布距离2.49 Kb,有234条(1.11%)含有1个以上的SSR。在所检测的SSR中,二、三、四核苷酸重复是主导重复类型,分别占EST-SSR总数的21.80%(1 181条)、52.55%(2 846条)和14.55%(788条)。AG/CT、AAG/CTT与AGG/CCT和AAAG/CTTT...
【关键词】地涌金莲 EST-SSR 多态性引物 分子标记
【基金】林业公益性行业科研专项(200904053); 云南应用基础研究面上项目(2009ZC188M)
【所属期刊栏目】林业科学研究
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