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菊花节律钟输出基因CmGI(GIGANTEA)的cDNA全长克隆、序列信息及定量表达分析

2012-07-01分类号:S682.11

【作者】孙霞  王秀峰  郑成淑  邢世岩  束怀瑞  
【部门】山东农业大学园艺科学与工程学院  作物生物学国家重点实验室  山东农业大学林学院  国家苹果工程技术中心  
【摘要】【目的】克隆菊花节律钟输出基因GIGANTEA的cDNA全长序列,进行序列信息学分析,研究其mRNA的相对定量表达。【方法】利用多聚酶链式反应(PCR)结合5′RACE、3′RACE技术,克隆节律钟输出基因GIGANTEA的cDNA全长序列,应用生物信息学软件对获得的基因核苷酸序列及编码的蛋白质序列进行分析;通过在线建模软件对蛋白质的三维结构进行建模预测;利用实时荧光定量PCR技术,用2-△△Ct法进行GIGANTEA的mRNA相对定量表达分析。【结果】从菊花品种‘Jinba’中克隆得到节律钟输出基因GIGANTEA的cDNA全长序列,核苷酸序列长度3 461 bp,开放阅读框3 453 bp...
【关键词】菊花  花芽分化  节律钟输出基因CmGI  定量表达
【基金】国家自然科学基金项目(30872040); 山东省自然科学基金项目(ZR2009DM003)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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