苹果茎尖组织中GA2ox基因的结构特征及蛋白序列的生物信息学分析
2012-10-28分类号:S661.1
【部门】青岛农业大学园林园艺学院
【摘要】GA2ox是赤霉素合成代谢的关键酶,以苹果品种富士茎尖为供试材料,应用同源克隆技术克隆GA2ox基因,获得长度为1 656 bp的DNA序列和1 014 bp cDNA序列。对比分析表明,DNA序列存在3个外显子和2个内含子。GA2ox的开放性阅读框编码337个氨基酸残基,推断其相对分子量为37.679 8 kDa,等电点为6.41。蛋白质结构域检索表明,GA2ox属于依赖于2-酮戊二酸的双加氧酶家族成员;氨基酸同源性分析表明,GA2ox与已报道的其他植物的GA2ox氨基酸序列同源性为51%~97%;氨基酸聚类分析表明,苹果和梨首先聚类,其次是毛果杨。
【关键词】苹果 GA2ox 保守结构域 氨基酸同源性分析 氨基酸聚类分析
【基金】山东省良种工程项目; 青岛市科技计划基础研究项目(11-2-4-5(4)-jch)
【所属期刊栏目】华北农学报
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