辣椒多态性EST-SSR标记开发及连锁图谱构建
2012-04-25分类号：S641.3
【部门】湖南省农业科学院蔬菜研究所 中国农业科学院蔬菜花卉研究所 湖南省农业科学院西瓜甜瓜研究所 湖南农业大学生物安全科学技术学院
【摘要】采用SSR检索程序,从辣椒221 037条unigenes中筛选到17 319个SSR位点,设计了10 468对引物,并对其进行E-PCR多态性检测。结果表明,1 538对引物具有多态性,其中554条辣椒EST序列能匹配到番茄基因组上,构成了12条辣椒EST-SSR连锁群,平均每条连锁群含45.75个EST-SSR。对匹配到番茄基因组上的EST-SSR进行GO(gene ontology)分类,结果有481条EST序列被分类,其中以初生代谢、细胞代谢、生物合成过程为主,分别占34.13%、28.35%、25.82%。在KEGG map中,91条EST序列共涉及到76条代谢途径(KEGG),约6...
【关键词】辣椒 多态性 连锁图谱 表达序列标签技术 简单重复序列
【基金】国家自然科学基金项目(31101425)
【所属期刊栏目】湖南农业大学学报(自然科学版)
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