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十字花科植物HSP22基因同源序列的克隆与进化分析

2012-07-30分类号:S63

【作者】程影  黄锐之  钟新民  侯喜林  吴学龙  王五宏  李必元  刘智宏  
【部门】南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室  浙江省农业科学院蔬菜研究所  浙江省农业科学院病毒学与生物技术研究所  浙江省植物代谢基因工程试验基地  
【摘要】采用PCR克隆技术,根据已报道的拟南芥的AtHSP22基因全长及其他物种同源序列设计特异引物,在十字花科植物大白菜、普通白菜、芥菜型油菜、甘蓝型油菜、花椰菜、芥菜、荠菜、萝卜3个属10个物种中成功克隆得到耐热相关基因HSP22的同源序列10条。序列比对分析表明:这些同源序列的相似性达89.3%以上,所推导的氨基酸序列相似性达92.1%以上。由进化树可直观地看出,芸薹属与荠属亲缘关系最近,首先聚为一类;其次与萝卜属、拟南芥属聚为一类。由氨基酸序列预测的高级结构存在明显差异,且无规则卷曲最多,α-螺旋均在30%以上,因而属于α结构蛋白。
【关键词】十字花科植物  HSP22基因  克隆  进化分析
【基金】国家863计划项目(2008AA02Z103); 浙江省农业科学院科技创新项目
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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