杜仲幼果和成熟果实转录组数据组装及基因功能注释
2012-10-15分类号：S567.19
【部门】中南林业科技大学生命科学与技术学院 中国林业科学研究院经济林研究开发中心 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室 中南林业科技大学林学院
【摘要】对杜仲幼果和成熟果实进行测序后,共获得了53 080 588个reads片段,包含了4 777 252 920个核苷酸序列信息,对reads进行拼接,共获得了921 902个Contig片段,序列信息达到了129 461 462 nt;在Contig数据的基础上,进一步采用over-lap的方法进行拼接,共获得了190 518个Scaffold片段,序列信息达到了67 868 367 nt;在Scaffold数据的基础上,进一步拼接,数据共获得了64 474个Unigene片段,序列信息达到了39 120 703 nt;Unigene和COG数据库进行比对表明,杜仲幼果和成熟果实转录组中的Un...
【关键词】杜仲 幼果 成熟果实 转录组 基因功能
【基金】林业公益性行业科研专项“杜仲育种群体建立与综合利用技术研究”(201004029)
【所属期刊栏目】中南林业科技大学学报
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