芝麻发育转录组分析
2012-04-01分类号：S565.3
【部门】河南省农业科学院河南省芝麻研究中心
【摘要】【目的】系统了解芝麻发育及种子形成转录组特征,丰富芝麻转录组数据信息。【方法】选用6份芝麻样品(5个不同芝麻品种的完整植株、1份不同发育阶段的芝麻籽粒),构建转录组测序文库并进行Illumina RNA-seq双端测序及生物信息学分析。【结果】共获得原始数据12.69 Gb,有效数据8.80 Gb。通过de novo拼接获得了长度大于100 bp的转录物26 837条(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/TSA.html,登录号:JP631635—JP668414);转录物总长度18.35 Mb,平均长度683 bp,N50长度1 006 bp。转录物注释结...
【关键词】芝麻 发育 转录组测序 生物信息学分析
【基金】国家重点基础研究发展计划“973”项目(2011CB109304); 现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-15)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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