大豆苹果酸脱氢酶基因的电子克隆与生物信息学分析
2012-06-28分类号：S565.1
【部门】河北农业大学教育部"华北作物种质资源研究与利用"重点实验室 河北农业大学
【摘要】利用电子克隆技术获得大豆中的苹果酸脱氢酶基因cDNA序列,并对基因及其编码蛋白进行生物信息学分析和预测,为进一步克隆该基因、解决植物磷高效基因数量缺乏等问题提供依据。结果表明,大豆中的苹果酸脱氢酶基因(GmMDH1)cDNA序列长度为1 574 bp,开放阅读框1 230 bp,编码409个氨基酸残基;编码蛋白含有NAD bindingsite,Dimerization interface,Substrate binding site,MDH_glyoxysomal_mitochondrial结合位点和保守域,属于LDH_MDH_like Superfamily家族;亚细胞定位分析显示,编码蛋...
【关键词】磷高效基因 大豆 苹果酸脱氢酶 电子克隆
【基金】国家转基因重大专项资助项目(2009ZX08004-004B); 国家自然科学基金项目(31071441); 河北省自然科学基金项目(C2010000749); 河北省教育厅科学研究项目(2009)
【所属期刊栏目】华北农学报
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