基于SNPs标记的部分栽培稻品种遗传结构分析
2012-08-28分类号:S511
【部门】沈阳农业大学 辽宁省农业生物技术重点实验室 黑龙江省农业科学院耕作栽培研究所 辽宁省北方粳稻育种重点实验室
【摘要】利用分布于水稻12条染色体上的190个SNPs位点,对97个水稻品种进行了遗传多样性和遗传结构分析。结果表明,190个SNPs位点中有92个具有多态性,多态性比率为48.42%。品种间的遗传相似系数(GS)变化范围在0.34~1.00之间,平均GS为0.87。贝叶斯聚类和UPGMA法聚类的结果相似,均将供试材料分成籼、粳2个亚种,且品种间的亲缘关系与地理来源关系不大。通过SNPs标记的遗传多样性分析结果表明,供试材料在亚种内的亲缘关系较近、遗传基础狭窄,部分供试品种具有相似的遗传背景。
【关键词】SNPs标记 水稻品种 遗传结构 遗传多样性
【基金】“十二五”国家科技支撑计划(2011BAD35B02-01); 国家自然科学基金(30971845); 辽宁省农业生物技术重点实验室专项资金
【所属期刊栏目】华北农学报
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