应用抑制性差减杂交技术分离椪柑枯水相关基因
2012-03-01分类号:S436.66
【部门】西南大学园艺园林学院 中国农业科学院柑桔研究所 西南大学食品科学学院
【摘要】【目的】探索椪柑枯水分子机理,寻找柑橘枯水应答基因,为柑橘枯水防治奠定基础。【方法】利用抑制性差减杂交技术以椪柑正常果肉cDNA作为Driver,以枯水果肉cDNA作为Tester构建正向差减文库。【结果】挑选了300个有效克隆进行测序分析,260个测序成功。经BLASTx比对分析,197条表达序列标签(ESTs)找到了分属于52个基因的同源序列;63条ESTs同源性较低或没有同源性。对文库中编码β-微管蛋白、衰老相关蛋白、细胞色素c、半胱氨酸蛋白酶、磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶、转运蛋白、天冬氨酸蛋白酶前体、WRKY转录因子21的基因进行实时定量RT-PCR验证,结果显示这8个基因均明显上调表达。...
【关键词】椪柑 抑制性差减杂交 枯水 表达序列标签 差减文库 聚类分析
【基金】重庆市自然科学基金项目(CSTC,2010BB1154); 重庆市科技攻关项目(CSTC,2011AC1023); 国家公益性行业(农业)科研专项(201203034)
【所属期刊栏目】中国农业科学
文献传递