7种作物叶绿体基因的密码子偏好性及聚类分析
2012-08-28分类号:S33
【部门】河南省农业科学院小麦研究中心 河南省小麦生物学重点实验室
【摘要】研究作物叶绿体蛋白编码基因的编码特点,对指导农作物的叶绿体基因工程研究设计,促进外源基因在受体作物中的高效、稳定表达具有重要作用。为此,综合运用了多种分析软件,对7种大田作物的叶绿体蛋白编码基因进行分析。结果表明:叶绿体蛋白编码基因的总碱基构成在7种作物中差异不大,都是A含量最高,而G,C的含量较低;但在密码子第3位的碱基构成上却有明显差别,3种双子叶作物偏爱以C,T结尾的密码子,而禾本科的4种作物则偏爱以T,C结尾的密码子;RSCU(同义密码子的相对使用度)值显示出禾本科作物有26个密码子具有偏好性,而双子叶作物有25个密码子具有偏好性,但二者之间有22个相同的偏好性密码子。基于RSCU值的...
【关键词】作物 叶绿体基因 密码子偏好性 聚类分析
【基金】农业部转基因生物新品种培育科技重大专项(2009ZX08002-002B;2009ZX08002-014B)
【所属期刊栏目】华北农学报
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