【摘要】本文运用DEA方法对2000-2009年我国高校科研效率的整体发展状况进行了评价,进而运用Malmquist指数对高校科研效率的动态变化进行分析。研究结果表明:我国高校科研的投入产出状况整体上是有效的,并且科研技术效率呈现出东部高于中部、中部高于西部的态势。但是目前科研效率的增长是非持续的,而且引发科研效率增长的主要因素是规模效率和技术进步。因此,应该采取合理调配教育资源配置、改革高校科研评价机制、制定与实施高校科技发展规划等措施,旨在促进地区间高校科研均衡发展,提高高校科研增长质量和保证高校科研稳定持续增长。