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基于16S rRNA技术的长江口微生物分子生物学鉴定与分析

2011-03-15分类号:X172

【作者】曹波  杨红  许强华  刘榕磊  
【部门】上海海洋大学海洋科学学院  
【摘要】基于2007年12月与2008年6月长江口上海附近海域采集的海水样品,使用27F和1492R两种通用引物对海洋微生物16S rRNA基因片段进行直接扩增,克隆并测序,构建细菌16S rRNA文库,通过NCBI数据库的基因比对,区分微生物种群,并使用Mega 4.0软件利用16S rRNA序列建立微生物的分子发育树。通过直接提取DNA进行扩增的方法,共检测出17个属的53种不同微生物,微生物种群结构随温度变化明显,优势种随温度变化有所不同,在不同季节水温下,微生物优势种优势明显;冬季以不动杆菌属为优势种群,分子发育树体现的遗传差异性较小;夏季微生物种群结构较复杂,其中以希瓦氏菌属及假单胞菌属为优...
【关键词】长江口  16S rRNA  微生物  种群鉴定
【基金】上海市908专项(ST1/ST2PJ1-2HD3); 长江口中华鲟保护区周边水域中华鲟的分布及栖息地选择监测(D8005090331)
【所属期刊栏目】上海海洋大学学报
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