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锦鲤疱疹病毒-CJ株ORF81基因的克隆及生物信息学分析

2011-12-15分类号:S941

【作者】周井祥  李新伟  王好  吕文亮  朱霞  
【部门】吉林农业大学动物科技学院动物生产及产品质量安全教育部重点实验室  
【摘要】为了解锦鲤疱疹病毒中国吉林株(KHV-CJ)ORF81蛋白的结构特征和进化关系,用框镜鲤尾鳍原代细胞增殖KHV-CJ,提取其DNA,经PCR扩增,获得ORF81基因,将其克隆到pMD18-T载体中,构建重组质粒。应用生物信息学方法初步分析KHV-CJ ORF81基因的结构和功能,并与GenBank上已公布的3株KHV构建系统进化树。结果显示,获得了长771 bp的ORF81基因,编码256个氨基酸;预测ORF81基因的理论分子量为28 246.50 u,等电点为8.404;疏水性大于亲水性;信号肽切割部位最可能位于29位的S(丝氨酸);有4个跨膜区;抗原表位预测显示抗原性良好;结构预测显示,不...
【关键词】锦鲤疱疹病毒  ORF81基因  克隆测序  生物信息学分析
【基金】国家自然科学基金项目(30671621)
【所属期刊栏目】水产学报
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