大鳍鳠免疫球蛋白M重链基因的克隆及表达分析
2011-11-15分类号:S941
【部门】西南大学生命科学学院水产科学重庆市市级重点实验室三峡库区生态环境教育部重点实验室淡水生物生殖与发育教育部重点实验室 暨南大学水生生物研究所
【摘要】用RACE-PCR和RT-PCR方法获得大鳍鳠分泌型免疫球蛋白M(sIgM)重链基因的全长cDNA序列。大鳍鳠sIgM的cDNA全长为1 992 bp,包含5'非编码区53 bp,3'非编码区226bp,开放阅读框1 713,编码570个氨基酸。推测的大鳍鳠sIgM蛋白质序列可变区含有4个骨架区(FR)和3个互补决定区(CDR),恒定区(CH)含有CH1、CH2、CH3和CH4 4个部分。与其它6种硬骨鱼类IgM氨基酸序列比对分析表明,大鳍鳠sIgM存在半胱氨酸和色氨酸保守位点;其氨基酸序列与斑点叉尾IgM的相似性最高,为54.3%;与石斑鱼的相似性最低,为24.6%。进化树分析表明,大鳍鳠s...
【关键词】大鳍鳠 IgM重链基因cDNA 克隆 实时荧光定量PCR 组织分布
【基金】国家“八六三”高技术研究发展计划(2011AA10A216); 重庆市科技攻关计划项目(CSTC.1010AC1116); 三峡库区生态环境教育部重点实验室基金资助项目
【所属期刊栏目】水产学报
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