鲤基因组中1个新Tc1类转座子的发现与鉴定
2011-11-15分类号：S917.4;Q75
【部门】中国水产科学研究院生物技术研究中心 上海海洋大学水产与生命学院
【摘要】在鲤(Cyprinus carpio)基因组中鉴别出一个新的具有潜在转座活性的Tc1类转座子,并命名为CCTN转座子(Cyprinus carpio Transposon,CCTN)。CCTN转座子全长1 611 bp,由两端约214 bp的反向重复序列(Inverted Repeat,IR)和中间不间断的996 bp的转座酶开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)组成。CCTN转座子推测的转座酶序列中存在完整的DD(34)E结构域,此结构域是Tc1类转座酶作用的必需位点之一。采用实时荧光定量PCR评估CCTN转座子在鲤基因组中的拷贝数约为2.28×103,占全基因组的0.2...
【关键词】Tc1 转座子 鲤 拷贝数 重复序列
【基金】国家863计划项目(2009AA10Z105); 农业部公益性行业科研专项项目(200903045); 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(2009B002)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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