三疣梭子蟹微卫星富集文库的构建与群体遗传分析
2011-01-15分类号:S917.4
【部门】中国海洋大学 中国水产科学研究院黄海水产研究所
【摘要】采用富集文库–菌落原位杂交法分离了30个三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)的微卫星标记。三疣梭子蟹基因组DNA经HaeⅢ酶切连接后,用固定了(AC)15和(AG)15探针的尼龙膜(Hybond N+)捕捉含有微卫星的片段,转化至大肠杆菌DH5α中,构建三疣梭子蟹微卫星富集文库。菌落原位杂交后,任意选取150个克隆进行测序,阳性克隆率为85.48%。利用软件设计了105对微卫星引物,筛选到稳定扩增标记56对,采用30个三疣梭子蟹个体进行多样性评价,30个位点均表现出多态性。观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)及多态性信息含量(PIC)的范围分别为0.222 2~1....
【关键词】三疣梭子蟹 富集文库 菌落原位杂交 微卫星标记 遗传多样性
【基金】国家863高技术研究发展计划项目(2006AA10A406); 国家自然科学基金项目(30871933,40806067); 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(2008-ts-11)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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