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日本蟳微卫星富集文库的建立与多态性标记的筛选

2011-01-15分类号:S917.4

【作者】宋春妮  李健  刘萍  陈萍  高保全  
【部门】中国水产科学研究院黄海水产研究所  大连海洋大学生命科学与技术学院  
【摘要】采用磁珠富集法筛选日本蟳微卫星分子标记。日本蟳基因组DNA经Sau3 AⅠ酶切后,收集400~1 200 bp大小的片段并纯化,利用生物素标记的寡核苷酸探针(AC)15从中筛选出含有微卫星序列的DNA片段,连接到pMD18-T载体中,构建富集微卫星序列的基因组文库,经PCR检测筛选出阳性克隆进行测序。从随机挑选的970个菌落中筛选出369个阳性克隆进行测序,结果86.99%(321个)含有微卫星序列,其中完美型占80.54%,非完美型占15.95%,混合型占4.28%。除使用的探针AC重复外,还得到GA、CT等重复序列。共设计出102对微卫星引物,其中65对能扩增出清晰条带,27对具有多态性。...
【关键词】日本蟳  微卫星  磁珠富集法
【基金】国家“八六三”高技术研究发展计划(2006AA10A406); 青岛市科技计划项目(07-2-3-5-jch)
【所属期刊栏目】水产学报
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