【摘要】研究所用序列由长牡蛎fosmid文库末端测序获得。首先用TRF程序扫描序列获得一批重复单元为2碱基的候选SSR位点,然后在部分SSR序列两侧的保守区设计50对引物,对取自山东青岛的一个长牡蛎野生群体进行基因型分析。结果显示,共有17个SSR位点显示多态性,等位基因数(Na)平均为4,有效等位基因数(Ne)平均为2.82,平均杂合度观测值(Ho)和期望值(He)分别为0.395 9和0.628 8。其中,11个位点的多态信息含量(PIC)值均大于0.5,共有49个等位基因,适合对长牡蛎群体遗传结构的分析;6个位点0.25

【关键词】长牡蛎  简单重复序列  基因组  遗传多样性

【基金】国家“九七三”重点基础研究发展计划(2010CB126402); 国家自然科学基金重点项目(40730845); 国家公益性行业(农业)科研专项(3-53)

【所属期刊栏目】水产学报

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