奶牛瘤胃微生物BAC文库中ACCase基因的筛选与生物信息学分析
2011-03-01分类号：S852.6
【部门】中国农业科学院北京畜牧兽医研究所/动物营养学国家重点实验室 中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室
【摘要】【目的】从奶牛瘤胃微生物BAC文库中筛选含乙酰CoA羧化酶(ACCase)基因的克隆子,并对其全长测序和生物信息学分析。【方法】利用PCR序列驱动筛选法,从瘤胃微生物BAC文库中筛选ACCase基因,鸟枪法测定基因序列后,进行基因注释、比对和系统发育分析。【结果】筛选得到了含ACCase基因的克隆(U12),其插入片段序列(URE12)全长43 358 bp,GC含量为43.75%,经GeneMark程序预测含有38个基因,经Signature程序预测属于变形菌门。ACCase基因(Acc-32)编码159个氨基酸,与Elusimicrobium minutum的ACCase基因具有41%的相...
【关键词】瘤胃微生物 BAC文库 乙酰CoA羧化酶 基因注释 生物信息学
【基金】国家“973”计划项目(2011CB100804)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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