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基于线粒体COⅠ基因序列分析家鸭系统发育关系

2011-11-30分类号:S834

【作者】虞德兵  陆应林  徐昊翔  徐善金  熊锴  王伟兰  杜文兴  王林云  
【部门】南京农业大学动物科技学院  
【摘要】根据北京鸭线粒体DNA(mtDNA)序列设计引物,对中国9个地方鸭和1个番鸭品种线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ(COⅠ)基因序列进行PCR反应和测序,并从起始密码子开始分析了1 520 bp的序列。结果显示:所有家鸭个体在1 517位点出现1个T碱基缺失,番鸭与家鸭的mtDNA COⅠ基因碱基组成相似;9个鸭品种个体共检出11种单倍型,单倍型的多样度为0.856。聚类分析结果显示,所有家鸭品种间的遗传距离为0.001~0.002,种内平均值为0.001;番鸭与家鸭遗传距离为0.003~0.006。基于Kimura-2模型构建的系统发育进化树进行分析,发现所测定的鸭科物种个体大体分为3类:家鸭与栖鸭属的...
【关键词】鸭  细胞色素氧化酶Ⅰ  DNA条形码  线粒体
【基金】江苏省自然科学基金项目(SBK201021501); 教育部高校博士点新教师基金项目(200803071048); 南京农业大学青年科技创新基金项目(KJ09013); 江苏省农业科技自主创新资金项目(cx(09)116)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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