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杨树抗逆转录因子基因内SSR标记的开发

2011-08-15分类号:S792.11

【作者】王保垒  王博文  陈清清  李百炼  张德强  
【部门】北京林业大学林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室  
【摘要】利用直接测序法开发小叶杨抗逆转录因子基因内一套新的核基因组SSR标记。通过对3个抗逆转录因子共21个成员在36个小叶杨基因型个体中的序列比较分析后共检测到31个SSR多态性位点,SSR出现的频率为1/1916bp。在小叶杨自然群体中,SSR多态性位点的碱基重复呈现出2~5碱基形式,基元重复次数变异范围为3~20次,其中以二碱基重复的位点较多,占总数的51.6%。在此基础上,依据SSR位点两侧的保守序列,设计31对SSR位点PCR扩增引物对。利用设计的引物检测所开发的SSR位点在杨属内22个基因型个体中PCR扩增的有效性及SSR位点的保守性。PCR扩增结果显示,93.5%的SSR位点能够在杨属内...
【关键词】杨树  抗逆性状  转录因子  基因内SSR标记
【基金】国家林业公益性行业科研专项经费项目(201004009); 教育部新世纪优秀人才支持计划专项基金(NCET-07-0084)
【所属期刊栏目】林业科学
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