毛果杨全基因组铵转运蛋白家族成员及其序列分析
2011-02-10分类号：S792.11
【部门】西北农林科技大学生命科学学院 中国科学院遗传与发育生物学研究所 西北农林科技大学植物保护学院 西北农林科技大学林学院
【摘要】【目的】探讨毛果杨(Populus trichocarpa)全基因组中铵转运蛋白(AMTs)家族成员的系统发育及部分成员的理化性质、结构和亚细胞定位。【方法】以从毛果杨全基因组数据库中搜索并筛选得到的目标蛋白序列为基础,应用软件CLUSTALX 2.0、GeneDOC和MEGA4,对AMTs家族成员的系统发育进行了分析,并重点分析了AMT1亚家族成员PtrAMT1-1、PtrAMT1-6和AMT2亚家族成员PtrAMT2-1、PtrAMT4-5的保守基序、理化参数、亲/疏水性、跨膜域、三级结构及亚细胞定位。【结果】在毛果杨基因组数据库中发现了19个AMTs,8个属于AMT1亚家族,11个属于A...
【关键词】铵转运蛋白 杨树 基因组 序列分析
【基金】教育部新世纪优秀人才支持计划项目(NCET-08-0468);教育部高等学校博士学科点专项科研基金项目(20090204110027); 霍英东教育基金会项目(121026)
【所属期刊栏目】西北农林科技大学学报(自然科学版)
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