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基于近缘物种SSR引物和EST-SSR序列的梅花SSR引物开发

2011-09-15分类号:S685.17

【作者】吴根松  孙丽丹  张启翔  潘会堂  蔡明  
【部门】北京林业大学园林学院国家花卉工程技术研究中心  
【摘要】为获得更多的梅花SSR引物,本研究筛选了84对梅花近缘物种的引物,并从梅花EST数据库的序列中设计了23对EST-SSR引物,用12个梅花品种对这些引物进行了多态性检测。结果表明,近缘物种的引物有69对能扩增出条带,有效扩增率达82.1%,从中筛选的14对引物共得到85个等位基因,平均值为6个。有效等位基因数在2.072~5.539之间,平均值为4。PIC多态信息指数在0.483~0.786之间,平均值为0.695。Shannon指数的平均值为1.528。12个品种遗传相似系数在0.13~0.60之间,平均值为0.26。‘玉蝶龙游’梅和‘小玉蝶’相似系数最大,为0.60;‘美人’梅和‘黄金’梅...
【关键词】近缘物种  EST  梅花  SSR
【基金】林业公益性行业科研专项(201004012); 北京市教育委员会共建项目建设计划“梅花远缘杂交新品种选育及核心种质的保存繁殖与示范”; 国家生物育种专项高技术产业化项目计划“云南‘丽江照水’梅良种高技术产业化示范工程”
【所属期刊栏目】北京林业大学学报
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