牡丹SCoT分子标记正交优化及引物筛选
2011-10-28分类号：S685.11
【部门】河南科技大学农学院 河南科技大学林学院 中国洛阳国家牡丹基因库
【摘要】以牡丹基因组DNA为模板,采用L16(45)正交试验设计对影响目标起始密码子多态性-聚合酶链式反应(SCoT-PCR)的五因素(Taq酶用量、Mg2+浓度、模板DNA用量、dNTPs浓度和引物浓度)进行优化试验,建立了优化的牡丹SCoT-PCR反应体系:Mg2+2.50 mmol/L、dNTPs 0.25 mmol/L、引物0.60μmol/L、Taq DNA聚合酶0.50 U、模板DNA 1.00 ng/μL,1×PCR-Buffer,总体积20.00μL。比较各因素对扩增反应的结果,其中以Mg2+浓度的影响最大,DNA模板用量的影响最小。运用牡丹17个品种验证了该体系稳定可靠,并从36个S...
【关键词】牡丹 SCoT-PCR 反应体系 正交设计 引物筛选
【基金】国家自然科学基金(31070620); 河南省重大科技攻关项目(091100110100),河南省重点科技攻关项目(092102110024); 洛阳市科技攻关项目(0802017A)
【所属期刊栏目】华北农学报
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