荔枝EST资源的SSR信息分析及EST-SSR标记开发
2011-10-01分类号：S667.1
【部门】广东省农业科学院果树研究所 农业部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室 华南师范大学生命科学学院 华南农业大学园艺学院
【摘要】【目的】明确荔枝EST序列中SSR的总体特点,开发荔枝EST-SSR引物,为利用EST-SSR分子标记进行荔枝种质资源遗传多样性、连锁图谱构建及亲缘关系研究奠定基础。【方法】应用SSRIT软件,按照设定标准从自行构建的一个荔枝果皮发育关键期的cDNA文库中的1 331条Unigene(惟一序列)中搜索SSR位点。利用软件Primer primer5.0设计EST-SSR引物。选用16份表型差异较大的荔枝种质资源检测引物的有效性及多态性,利用聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)进行片段分离。【结果】荔枝的1 331条EST序列中共搜索出220个SSR位点,分布于189条EST中,出现频率是16.53%。这...
【关键词】荔枝 EST SSR
【基金】国家荔枝产业技术体系项目; 广东省现代农业产业技术体系项目(岭南水果创新团队); 国家自然科学基金项目(30900980); 广东省自然科学基金项目(9451064001003535,10151064001000017)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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