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基于柑橘及其近缘属植物DNA条形码的叶绿体编码序列筛选

2011-01-16分类号:S666

【作者】于杰  闫化学  鲁振华  周志钦  
【部门】西南大学南方山地园艺学教育部重点实验室  中国农业科学院郑州果树研究所  西南大学园艺园林学院  
【摘要】【目的】通过对柑橘及其近缘属植物叶绿体4种编码序列的测定分析,获得能进行DNA条形编码的特征序列,为进一步研究叶绿体非编码区序列奠定基础。【方法】对柑橘及其近缘属植物59份样品进行matK、rpoB、rpoC1、rbcL测序,序列比对与人工校正,计算属间、种间、种内的遗传距离,比较序列间的差异,建立系统发育树。【结果】4种序列中,matK序列在属间、种间差异最大,与其它序列相比具有显著性差异,rbcL序列次之,而rpoB、rpoC1序列两者间没有显著性差异。【结论】matK序列是柑橘及其近缘属植物DNA条形码的未来研究中一个重要的候选片段。
【关键词】柑橘属  近缘属  DNA条形码  编码序列
【基金】国家自然科学基金项目(30671450); 重庆市自然科学基金项目(CSTC2009BB1119); 西南大学科研基金项目(SWU208042)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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