葡萄EST-SSR标记的开发及其应用
2011-07-30分类号：S663.1
【部门】南京农业大学园艺学院/江苏省果树品种改良与种苗繁育工程中心 中国农业科学院郑州果树研究所
【摘要】从NCBI公共数据库中随机下载葡萄表达序列标签(expressed sequence tag,EST)8 925条,利用Phrap软件对这些序列进行拼接后形成5 642条序列,利用MISA软件共发掘出含有SSR位点的序列336条,共含有367个SSR位点,候选SSR位点出现的频率为6.50%。二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复单元的SSR数目分别为79(21.53%)、83(22.62%)、29(7.9%)、60(16.35%)和116(31.61%)。利用Primer 3.0 Plus软件随机设计50对引物进行PCR扩增,用6%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析这些SSR引物的P...
【关键词】葡萄 EST SSR 遗传多样性
【基金】江苏省科技支撑项目(BE2010326); 第36批留学回国科研启动基金项目
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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