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苹果基因组SSR位点分析与应用

2011-11-01分类号:S661.1

【作者】关玲  章镇  王新卫  薛华柏  刘艳红  王三红  乔玉山  
【部门】南京农业大学园艺学院  教育部园艺作物种质创新与利用工程研究中心  
【摘要】【目的】通过对‘金冠’苹果基因组SSR位点的统计分析,为蔷薇科果树应用SSR分子标记进行高通量的遗传分析提供理论与实践基础。【方法】运用NCBI数据库中‘金冠’苹果基因组数据,分析其SSR位点分布情况,并根据SSR位点的搜索结果,设计68对引物(每条染色体设计4对),利用苹果品种对所设计引物进行应用性验证并利用梨杂交群体进行通用性检测。【结果】苹果基因组中SSR序列主要是完全重复型,17条染色体共存在163 426个SSR位点,平均每隔3.22 kb存在1个。单核苷酸至三核苷酸重复基序在染色体水平上分布较均匀,而四核苷酸至六核苷酸重复基序的分布差异较大。单核苷酸与二核苷酸重复基序所占比例最大,...
【关键词】苹果  基因组  SSR  应用
【基金】国家“863”项目(2011AA100204,2008AA10Z157); 江苏省科技支撑计划项目(BE2008316)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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