南瓜属EST-SSR标记的开发及在杂种纯度鉴定中的应用
2011-12-28分类号：S642.1
【部门】国家蔬菜工程技术研究中心
【摘要】为利用SSR标记进行快速、准确的南瓜杂交种纯度分析,进行了南瓜EST-SSR标记的开发。从NCBI数据库下载1 457条南瓜属作物EST序列,去除冗余序列后进行SSR位点搜索,共得到215条含有SSR位点的EST序列。这些SSR位点包含111种重复基元,其中二核苷酸(62个,占28.84%)和三核苷酸(86个,占40.0%)重复类型占主导地位;重复基元中出现最多的是CT(21个,占9.77%),其次为TC(13个,占6.05%)和AAG(12个,占5.58%)。将215个SSR位点设计成EST-SSR引物后,随机合成了其中的43对引物。利用4份遗传背景差异较大的南瓜自交系对合成的43对引物进行...
【关键词】南瓜 EST-SSR 标记开发 杂种纯度
【基金】“十一五”科技支撑项目(2009BADB8B02); 北京市新世纪百千万人才工程培养资助项目(2008); 国家农业科技成果转化资金项目(2010GB2A000003); 北京市科委项目(D101105046510001); 北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX201101010-9);北京市农林科学院科研项目(2010A004)
【所属期刊栏目】华北农学报
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