玉米寡肽转运蛋白基因(ZmOPT0212)的克隆及其生物信息学分析
2011-02-28分类号:S513
【部门】河北农业大学国家玉米改良中心河北分中心
【摘要】根据玉米B73和水稻的寡肽转运蛋白全长序列设计引物,通过RT-PCR直接扩增的方法从玉米自交系478中克隆到了寡肽转运蛋白基因,命名为ZmOPT0212(Accession number:HM021150)。ZmOPT0212开放阅读框为2 151bp,编码716个氨基酸残基,等电点8.87,相对分子质量为77.4 kDa。预测由该基因转录的寡肽转运蛋白其二级结构约含43.85%的α-螺旋、13.27%的延伸链、3.91%的β-转角和38.97%的不规则卷曲,含有14个连续的疏水片断,其中12个可能构成跨膜螺旋;预测该转运蛋白不存在信号肽,亚细胞定位存在于细胞膜上。同源性和进化树的预测分析显示...
【关键词】玉米 寡肽转运蛋白(OPT) 克隆 生物信息学分析
【基金】转基因重大专项(2008ZX003-002); 河北省自然基金项目(C2008000319)
【所属期刊栏目】华北农学报
文献传递