枯草芽胞杆菌Bs-916的全基因组分析
2011-12-01分类号:S476.1
【部门】江苏农业科学院植物保护研究所
【摘要】【目的】对枯草芽胞杆菌Bs-916进行全基因组测序,为今后更好挖掘和利用该菌生防潜力提供较多的分子生物学信息。【方法】通过应用比较基因组学软件与另一测序菌株Bs168进行全基因组序列分析。【结果】Bs-916菌株全基因组大小为3 925 958 bp,GC含量为46.4%,与其它已测序全基因组芽孢杆菌相比,其GC含量最高;预测所得CDS数为4 056个,152个串联重复区域,转座子103个,IS(插入序列)序列数量37个,tRNA 46个,rRNA 39个;比较基因组学分析其含有8个NRPS/PKS基因簇,其中bacillomycin L,macrolactin,difficidin这3个基因...
【关键词】枯草芽孢杆菌 比较基因组学 共线性 GC偏好
【基金】国家自然科学基金(30971950,30900929)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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