栗疫菌CpIAP基因生物信息学分析及功能研究
2011-11-30分类号:S436.64
【部门】南京农业大学农作物生物灾害综合治理教育部重点实验室
【摘要】寻找栗疫菌的凋亡抑制蛋白(inhibitor of apoptosis proteins,IAPs)类蛋白,明确该蛋白与其他物种IAPs的进化关系,并对CpIAP基因功能进行初步研究。以IAPs家族的典型结构域"BIR"为靶标,对栗疫菌基因组数据库进行BLAST搜索。运用生物信息学对预测的CpIAP蛋白结构进行分析并构建系统进化树;采用同源重组的策略,构建CpIAP基因缺失突变体,并重新导入该基因全长片段获得互补株。结果从栗疫菌中鉴定了1个IAP基因,Southern blot验证为单拷贝。生物信息学分析表明:CpIAP基因全长2 997 bp,编码920个氨基酸,具有2个BIR结构域;进化关...
【关键词】栗疫菌 凋亡抑制蛋白(IAPs) 致病性 产孢能力
【基金】国家转基因生物新品种培育重大专项(2009ZX08009-055B)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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