云南水稻条纹病毒RNA3的分子变异及遗传多样性分析
2011-04-28分类号:S435.111.4
【部门】云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室 云南省农业科学院热带亚热带经济作物研究所
【摘要】为从分子水平上探讨云南水稻条纹病毒(RSV)分子变异及其遗传多样性,采用RT-PCR技术,对云南省大理州巍山县和昆明市宜良县2个分离物的RNA3进行克隆和测序,获得RNA3YWS和RNA3YYL全长序列,2个分离物的RNA3核苷酸序列长度分别为2489和2490 bp。并将获得的序列与不同时期、不同区域的RNA3全长序列进行比较,并对22条RNA3序列构建系统发育树。结果表明,YWS和YYL与YBS、YA、FYi等分离物具有更近的亲缘关系,与云南以外的中国分离物和日本T和M分离物亲缘关系较远,表明RSV在自然界中的分子变异与地理分布有着密切的关系。根据不同基因在核苷酸和氨基酸水平上的差异,探讨...
【关键词】水稻条纹病毒 RNA3 分子变异 遗传多样性
【基金】云南省自然科学基金(2003C0042M)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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