卵形鲳鲹线粒体COI基因全长序列的克隆与分析
2011-08-28分类号:S917.4
【部门】广西水产研究所广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室
【摘要】根据近源物种线粒体序列的同源比对,在COI基因上下游保守区域设计一对通用引物COF/COR。以卵形鲳鲹肌肉总DNA为模板,PCR扩增获得特异的DNA片段,经克隆、测序和比对证实该片段包含了卵形鲳鲹线粒体COI基因完整编码区1551bp。对5个个体分别测序后比对,发现卵形鲳鲹COI基因DNA序列在钦州湾种群个体间至少存在7个变异位点,使5个个体分别具有5种不同的单倍型。将卵形鲳鲹种内不同个体及鲹科其他物种的CO I核酸序列进行比较分析,根据比对结果构建鲳鲹科各物种的系统进化树,支持鲹科下设四个亚科(鲹亚科,鰤亚科,鲳鲹亚科,鰆鲹亚科)的分类系统。通过COI基因遗传距离计算发现,卵形鲳鲹种内不同地...
【关键词】卵形鲳鲹 线粒体 COI基因 系统发育进化树 DNA条形码
【基金】国家科技支撑计划项目(2007BAD29B03)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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