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鲢InDel-RFLP标记开发及其在连锁图谱构建中的应用

2011-03-15分类号:S917.4

【作者】张鹏  杨官品  张立楠  危起伟  邹桂伟  
【部门】中国海洋大学海洋生物遗传育种教育部重点实验室  中国水产科学研究院长江水产研究所  
【摘要】基于随机测序的鲢(Hypophthalmichthys molitrix)基因组片段,尝试开发基于InDel的限制性片段长度多态性标记(InDel-RFLP)。结果显示:共133个片段中,65个在一个野生鲢群体(该野生鲢群体采自长江流域荆州段,31个个体)中表现多态性。共检测到163个等位基因,每位点等位基因数从2到4不等,平均2.5个。65个多态性标记中,有35个被添加到鲢SSR-AFLP性别平均连锁图谱上。长约2 kb的片段比长约1 kb的片段更适用于InDel-RFLP标记开发。设计特异引物,扩增基因组片段,用4种限制性内切酶(BsuR I、Hha I、Taq I和Vsp I)之一切成适...
【关键词】鲢(Hypophthalmichthys molitrix)  碱基插入缺失  限制性片段长度多态性  连锁图谱
【基金】农业部淡水鱼类种质资源与生物技术重点开放实验室开放课题(LFB20070601); 现代农产品加工技术研发体系专项基金(nycytx-49-01)
【所属期刊栏目】淡水渔业
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