基于16SrRNA序列探讨龟鳖类的遗传分化和系统发生
2011-04-25分类号：S917.4
【部门】上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室 中国水产科学研究院东海水产研究所农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室 安徽农业大学动物科技学院
【摘要】用PCR和测序的方法,获得13种龟鳖类的线粒体16SrRNA基因片段序列,结合NCBI收录的47种龟鳖的线粒体16SrRNA基因序列,分析龟鳖类的遗传分化和系统发生。结果表明,对60条序列进行比对后得到480 bp的一致序列,其中,可变位点229个,总变异率为47.7%;简约信息位点186个,插入/缺失80个。腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)4种碱基的平均含量分别为33.6%、24.3%、18.5%、23.7%,转换与颠换比为1.95。7种闭壳龟种间的遗传距离为0.004～0.063,平均为0.03;潮龟科17个属间的遗传距离为0.053～0.120,平均为0.091;...
【关键词】龟鳖类 16SrRNA基因 遗传分化 分子进化 系统发生
【基金】农业部科技跨越计划项目(2009-跨-14); 安徽省教育厅项目(KJ2009B067); 中央级公益性科研院所基本科研项目(2008Z02)
【所属期刊栏目】湖南农业大学学报(自然科学版)
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