鳜胰蛋白酶基因外显子3上SNP G169A位点鉴定和四种不同检测方法的比较
2011-11-15分类号：S917.4
【部门】暨南大学生命科学技术学院
【摘要】采用PCR产物直接测序法(DS)对鳜(Siniperca chuatsi)胰蛋白酶基因(TRY)进行单核苷酸多态性(SNPs)分析,发现外显子3上的G169A多态性。对312个样品进行分析,共发现三种基因型GG、GA、AA,其基因型频率分别为0.26、0.54、0.20,两个等位基因G和A的基因频率分别为0.53和0.47。用创造限制性酶切位点法PCR(CRS-PCR)、单管双向等位基因专一性扩增(SB-ASA)和单链构象多态性分析(PCR-SSCP)对该SNP位点进行验证。结果表明,CRS-PCR法不能对该SNP位点分型,PCR-SSCP和SB-ASA法可以且准确度分别为100%和96.67...
【关键词】单核苷酸多态性 直接测序法 单链构象多态性分析 单管双向等位基因专一性扩增法 创造限制酶切位点法
【基金】广东省海洋渔业科技推广专项项目(A200899D02); 广州市番禺区科技计划项目(2009-Z-73-1); 广东省科技兴海(渔)项目(B200701A06); 广州市科技计划项目(2009Z1-E711)
【所属期刊栏目】淡水渔业
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