孔石莼在干出胁迫下上调表达基因消减cDNA文库的构建及分析
2011-05-15分类号:S917.3
【部门】辽宁师范大学生命科学学院辽宁省植物生物技术重点实验室
【摘要】利用抑制消减杂交技术构建了潮间带绿藻孔石莼(Ulva pertusa)在干出胁迫状态下上调表达基因的消减cDNA文库。获得的阳性克隆经测序得到150条上调表达的EST片段,其中21条为冗余序列(RS),137条非冗余序列(NRS)。片段中最长833 bp,最短106 bp,平均长度364 bp。参与比对的EST片段按照其注释功能可分类为:细胞生长与发育、蛋白合成与分解、代谢过程、胁迫应答、光合作用与光诱导、转录调节、信号转导等相关基因。未知功能和无对比结果序列共60条,占非冗余序列的43.80%。比对相似度主要分布在20%~60%之间,主要与已经完成基因组测序的藻类或高等植物的氨基酸序列具有较...
【关键词】孔石莼 潮间带 干出状态 抑制消减杂交 cDNA文库
【基金】中国科学院实验海洋生物学重点实验室开放基金资助项目
【所属期刊栏目】海洋渔业
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