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基于matK、rbcL和ITS序列的5种大叶藻系统发育研究

2011-02-15分类号:S917.3

【作者】李渊  孙典荣  李文涛  张沛东  江鑫  郭栋  高天翔  
【部门】中国海洋大学水产学院  中国水产科学研究院南海水产研究所  
【摘要】运用PCR直接测序法,对采自爱尔兰、日本、韩国和中国的大叶藻、矮大叶藻、丛生大叶藻和红须根虾形藻及GenBank中的宽叶大叶藻5种大叶藻叶绿体的matK、rbcL和核糖体ITS的部分序列进行测定,并比较分析了5种大叶藻3个目的片段的核苷酸序列,结果发现胞嘧啶(C)在3个目的片段上的含量均较低。ITS片段检测到172处核苷酸替换,表现出丰富的遗传多态性。matK基因片段上有52处核苷酸替换,rbcL基因片段上有20处核苷酸替换,且大部分替换来自于第三密码子的同义替换,种间在氨基酸水平上产生了一定的分化。基于ITS、matK和rbcL 3个目的片段,利用邻接法、最大简约法、最大似然法和贝叶斯法构建...
【关键词】大叶藻属  虾形藻属  matK  rbcL  ITS  系统发育关系
【基金】国家海洋公益项目(200805069); 国家自然科学基金项目(30700615)
【所属期刊栏目】水产学报
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