桑属ITS、trnL-F、rps16序列与进化分析
2011-04-16分类号：S888
【部门】西南大学生物技术学院/农业部蚕桑学重点开放实验室 重庆大学农学及生命科学研究院
【摘要】【目的】分析桑属ITS、trnL-F、rps16序列,探讨系统学价值。【方法】67份桑资源,经DNA提取、PCR扩增、测序,测序结果用软件拼接、比对,并从GenBank下载桑属ITS、trnL-F、rps16序列进行同源性分析,计算其长度、G+C(或A+T)含量、变异位点、信息位点,将3个序列合并,以构树、柘树为外类群,采用MP法分析进化关系。【结果】桑ITS(包括5.8S)基本序列长度为576 bp,变异范围为576—590 bp,G+C含量为59.55%—62.25%,40个信息位点;trnL-F(包括tRNA-Leu内含子)基本序列长度为923 bp,变异范围为920—924 bp,A+...
【关键词】桑属 ITS、trnL-F、rps16序列 MP分析法 进化关系
【基金】重庆市重大攻关项目(cq-2009001); 西南大学博士启动基金(swu110059)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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