高致病性PRRSV TJ株Nsp2蛋白的缺失及其二级结构预测
2011-08-25分类号:S852.65
【部门】中国农业科学院特产研究所人兽共患病研究室
【摘要】根据GenBank上发表的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)TJ株F3代全基因序列(GenBank登录号为EU860248),结合多个PRRSV亚洲株Nsp2基因比对结果,设计合成引物,选择高致病性PRRSV TJ株噬斑克隆纯化前后14个不同代次,利用合成的引物扩增各代次Nsp2基因的高变区片段及F3代和F92代Nsp2全基因,并进行产物克隆和氨基酸序列分析及结构预测。测序结果表明:PRRSV TJ株在克隆传代过程中出现了序列整段缺失,共缺失120个氨基酸,并且从F18代噬斑克隆开始一直稳定存在。缺失高变区及Nsp2蛋白二级结构预测结果表明:缺失的氨基酸使Nsp2蛋白在空间结构上发生了较大的...
【关键词】猪繁殖与呼吸综合征病毒 非结构蛋白2 蛋白缺失 蛋白二级结构
【基金】国家“十一·五”科技支撑计划项目(2009BADB4B02)
【所属期刊栏目】湖南农业大学学报(自然科学版)
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