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几个提高抑制消减杂交(SSH)文库质量的技术改进

2011-10-28分类号:Q78

【作者】董登峰  李杨瑞  白云彩  
【部门】广西大学农学院  广西作物遗传改良生物技术重点实验室  
【摘要】抑制消减杂交(SSH)高灵敏、易操作、高效富集低表达丰度基因和均一化目的基因片断,广泛用于差异表达基因的分离和cDNA文库构建。在实验操作中常出现低表达mRNA和cDNA丢失、大片断连接效率低等问题,构建的文库质量差,文章通过改进萃取操作提高目的产物(mRNA和cDNA)回收率,回收率增加30%以上;通过采用PVPP、高浓度KAc专一性结合和LiCl沉淀等措施除去RNA中的多酚和多糖、进而增加可分离mRNA种类和含量,对应的Uni-EST种类增加近3倍,通过采用胶回收并分段连接保护大片断cDNA等措施使文库中转录本丰富度增加,大片段(500 bp以上)比例增大,cDNA平均长度增大,文库质量明...
【关键词】抑制消减杂交(SSH)  文库构建  技术改进
【基金】国家自然科学基金项目(30960209,31160054); 广西大学科研基金项目(X071054)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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